Die Arbeit der Ev. Allianz existiert in München schon viele Jahrzehnte als Beziehungsnetzwerk zwischen Verantwortlichen und Arbeitsplattform für Gemeinden.
Im November 2008 wurde die Ev. Allianz formal als "nicht rechtsfähiger Verein" konstituiert, um der Arbeit einen organisatorischen Rahmen zu geben.
